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AutoCAD的缺省目錄結構將程序和支持文件按邏輯關系分組，并使用樹狀結構的目錄和子目錄來實現(xiàn)。如圖29-1所示。 其中，AutoCAD系統(tǒng)主文件夾所在位置及名稱可在安裝時由用戶指定，主文件夾內的組織結構由AutoCAD自動設定，其中各子文件夾的說明見表29-1。 表29-1AutoCAD系統(tǒng)目錄結構說明

說明以上顯示的目錄結構為AutoCAD2002版，2000版中還有一個“Express”目錄，用于存放快捷工具文件，但沒有“WebDepot”目錄。
除此之外，AutoCAD還會建立其他一些專用的目錄，例如在引導磁盤中的“ProgramFiles”文件夾里面的“CommonFiles”子文件夾中，建立了一個名為“AutodeskShared”的目錄，用于存放AutoCAD公用文件；在系統(tǒng)收藏夾中建立一個名為“Autodesk”的目錄，作為AutoCAD系統(tǒng)的收藏夾；以及在操作系統(tǒng)目錄中的“AppclicationData”中建立其他一些存放AutoCAD文件的目錄。
專家提示用戶應將自己定義的文件與AutoCAD系統(tǒng)的程序和支持文件分開存放。這樣更容易查找可能的沖突，并可以單獨升級某個應用程序，而不影響其他應用程序。